Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLX4IPQ5VYV7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms