Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFI1BQ5VTD9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms