Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CT47A1Q5JQC4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CT47A1Q5JQC4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms