Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf116Q5BN46 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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