Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYTL3Q4VX76 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms