Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms