Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKOR2Q2VWA4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKOR2Q2VWA4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms