Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK4Q16654 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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