Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CARTPTQ16568 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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