Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
USF2Q15853 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USF2Q15853 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USF2Q15853 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USF2Q15853 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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