Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAMP3Q15836 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms