Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCOLCEQ15113 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms