Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERC3Q15034 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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