Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPNMBQ14956 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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