Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
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ERV3-1Q14264 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ERV3-1Q14264 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ERV3-1Q14264 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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ERV3-1Q14264 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERV3-1Q14264 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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