Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCINQ13939 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCINQ13939 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCINQ13939 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCINQ13939 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCINQ13939 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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