Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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ITGA9Q13797 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA9Q13797 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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