Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNASE1L3Q13609 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms