Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms