Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3FQ13275 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3FQ13275 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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