Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRJQ12913 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms