Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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RAB40BQ12829 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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