Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 SPO24YPR036W-A 204 nt2.34□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.34□□□□□ -2.03
SRF1Q12516 HER1YOR227W 3741 nt2.33□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 SSK2YNR031C 4740 nt2.33□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 PKH3YDR466W 2697 nt2.32□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 YCS4YLR272C 3531 nt2.31□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 PIK1YNL267W 3201 nt2.31□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 CHS1YNL192W 3396 nt2.31□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 VPS13YLL040C 9435 nt2.31□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 KOG1YHR186C 4674 nt2.3□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 TOF1YNL273W 3717 nt2.29□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 YAR009CYAR009C 3591 nt2.28□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 YLR419WYLR419W 4308 nt2.28□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 MGA2YIR033W 3342 nt2.28□□□□□ -2.04
SRF1Q12516 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.27□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 snR190snR190 190 nt2.27□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 ATG9YDL149W 2994 nt2.27□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.26□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 MSH6YDR097C 3729 nt2.26□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 IRE1YHR079C 3348 nt2.26□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 CHC1YGL206C 4962 nt2.26□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.25□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 PAU12YGR294W 363 nt2.25□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.25□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 PAU24YBR301W 363 nt2.25□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.22□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 TFC3YAL001C 3483 nt2.22□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 PMD1YER132C 5262 nt2.22□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 YLR422WYLR422W 5799 nt2.22□□□□□ -2.05
SRF1Q12516 FIG2YCR089W 4830 nt2.2□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 AI1Q0050 2505 nt2.19□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.19□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 snR38snR38 95 nt2.19□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 MSH3YCR092C 3057 nt2.19□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 FKS1YLR342W 5631 nt2.19□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 SPF1YEL031W 3648 nt2.18□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 KCS1YDR017C 3153 nt2.17□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 BRE1YDL074C 2103 nt2.17□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 NST1YNL091W 3723 nt2.16□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.16□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 CSF1YLR087C 8877 nt2.16□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 UTP21YLR409C 2820 nt2.16□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 PET127YOR017W 2403 nt2.16□□□□□ -2.06
SRF1Q12516 EMC5YIL027C 426 nt2.15□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 TOR2YKL203C 7425 nt2.15□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 KAP122YGL016W 3246 nt2.14□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 snR14snR14 160 nt2.12□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 DNF3YMR162C 4971 nt2.11□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 RAD50YNL250W 3939 nt2.11□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 TMA7YLR262C-A 195 nt2.11□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 SEC3YER008C 4011 nt2.11□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 TOR1YJR066W 7413 nt2.1□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.1□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 CLU1YMR012W 3834 nt2.1□□□□□ -2.07
SRF1Q12516 EST1YLR233C 2100 nt2.09□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 NIP1YMR309C 2439 nt2.09□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.08□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YOR093CYOR093C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 SKI7YOR076C 2244 nt2.07□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 DNF1YER166W 4716 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 FYV8YGR196C 2454 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YOL098CYOL098C 3114 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 RPL41AYDL184C 78 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 UBR2YLR024C 5619 nt2.06□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 ULP2YIL031W 3105 nt2.05□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 CDC25YLR310C 4770 nt2.05□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.05□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YML054C-AYML054C-A 159 nt2.05□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt2.05□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 YGR130CYGR130C 2451 nt2.04□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 STO1YMR125W 2586 nt2.04□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 MSN5YDR335W 3675 nt2.03□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 USO1YDL058W 5373 nt2.03□□□□□ -2.08
SRF1Q12516 snR69snR69 101 nt2.02□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt2.02□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 BRR2YER172C 6492 nt2.02□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 SKI3YPR189W 4299 nt2.02□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 TRM732YMR259C 4263 nt2.01□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 PRP16YKR086W 3216 nt2□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 SEC8YPR055W 3198 nt1.99□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 CFT1YDR301W 4074 nt1.96□□□□□ -2.09
SRF1Q12516 YSP1YHR155W 3687 nt1.96□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 CAT8YMR280C 4302 nt1.95□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 SMC4YLR086W 4257 nt1.95□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 BEM3YPL115C 3387 nt1.95□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 CSE1YGL238W 2883 nt1.94□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 RDS3YPR094W 324 nt1.94□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 LAA1YJL207C 6045 nt1.93□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 SPP41YDR464W 4308 nt1.93□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.93□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 DGR1YNL130C-A 147 nt1.92□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 APL3YBL037W 3078 nt1.92□□□□□ -2.1
SRF1Q12516 GEA2YEL022W 4380 nt1.9□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 NEO1YIL048W 3456 nt1.89□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 MEC1YBR136W 7107 nt1.88□□□□□ -2.11
SRF1Q12516 NUP145YGL092W 3954 nt1.87□□□□□ -2.11
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