Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 BRR2YER172C 6492 nt1.49□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 BST1YFL025C 3090 nt1.49□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 FYV10YIL097W 1551 nt1.48□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 KAP122YGL016W 3246 nt1.47□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 DNF3YMR162C 4971 nt1.47□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 SET3YKR029C 2256 nt1.47□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 TRM3YDL112W 4311 nt1.47□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 WAR1YML076C 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
TAF3Q12297 HKR1YDR420W 5409 nt1.46□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 NOP9YJL010C 2001 nt1.46□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 SBH1YER087C-B 249 nt1.46□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 STF2YGR008C 255 nt1.45□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 YLR232WYLR232W 348 nt1.44□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 snR190snR190 190 nt1.44□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 RCO1YMR075W 2055 nt1.43□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 APL3YBL037W 3078 nt1.41□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 CAT8YMR280C 4302 nt1.41□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.41□□□□□ -2.18
TAF3Q12297 RPL26BYGR034W 384 nt1.4□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 YLR041WYLR041W 321 nt1.4□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 YDR210WYDR210W 228 nt1.39□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 EST2YLR318W 2655 nt1.39□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 YCS4YLR272C 3531 nt1.39□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 NUP188YML103C 4968 nt1.38□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 AZF1YOR113W 2745 nt1.37□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.36□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 LAA1YJL207C 6045 nt1.35□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 RAD9YDR217C 3930 nt1.35□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.35□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 KAP120YPL125W 3099 nt1.35□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 TRM732YMR259C 4263 nt1.35□□□□□ -2.19
TAF3Q12297 ASE1YOR058C 2658 nt1.34□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 SWI4YER111C 3282 nt1.33□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 PRP16YKR086W 3216 nt1.33□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 COG6YNL041C 2520 nt1.33□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.32□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 MSN5YDR335W 3675 nt1.31□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 snR81snR81 201 nt1.31□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 YNL266WYNL266W 420 nt1.31□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 BIR1YJR089W 2865 nt1.31□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.31□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 BEM3YPL115C 3387 nt1.3□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.29□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 FIG2YCR089W 4830 nt1.29□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 SEC1YDR164C 2175 nt1.28□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 YDL073WYDL073W 2955 nt1.28□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.28□□□□□ -2.2
TAF3Q12297 NUP145YGL092W 3954 nt1.28□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.27□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.27□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 YLR422WYLR422W 5799 nt1.26□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 CDC39YCR093W 6327 nt1.26□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 SEC8YPR055W 3198 nt1.24□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 snR45snR45 172 nt1.24□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 UBP3YER151C 2739 nt1.24□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 SEC3YER008C 4011 nt1.23□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.23□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.23□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 CDC25YLR310C 4770 nt1.23□□□□□ -2.21
TAF3Q12297 NST1YNL091W 3723 nt1.2□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 CLU1YMR012W 3834 nt1.2□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.2□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 MSH3YCR092C 3057 nt1.19□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.19□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 VAM6YDL077C 3150 nt1.19□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.18□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YJR029WYJR029W 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 MYO1YHR023W 5787 nt1.17□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 NUP192YJL039C 5052 nt1.16□□□□□ -2.22
TAF3Q12297 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.15□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 ROM2YLR371W 4071 nt1.14□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 NNF2YGR089W 2811 nt1.14□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 DOP1YDR141C 5097 nt1.13□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 YSP1YHR155W 3687 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 SEC10YLR166C 2616 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.12□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 BUD3YCL014W 4911 nt1.11□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 snR62snR62 100 nt1.11□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 GLG1YKR058W 1851 nt1.11□□□□□ -2.23
TAF3Q12297 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 RPS26AYGL189C 360 nt1.07□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 CSE1YGL238W 2883 nt1.06□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 ANS1YHR126C 480 nt1.06□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.06□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 SCC2YDR180W 4482 nt1.05□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 REV3YPL167C 4515 nt1.05□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.05□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 RPM2YML091C 3609 nt1.04□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 RKR1YMR247C 4689 nt1.04□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.04□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.04□□□□□ -2.24
TAF3Q12297 HUG1YML058W-A 207 nt1.04□□□□□ -2.24
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