Protein–RNA interactions for Protein: Q12289

CRC1, Mitochondrial carnitine carrier, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CRC1Q12289 YLR041WYLR041W 321 nt1.25□□□□□ -2.21
CRC1Q12289 snR190snR190 190 nt1.25□□□□□ -2.21
CRC1Q12289 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.24□□□□□ -2.21
CRC1Q12289 RPL26BYGR034W 384 nt1.23□□□□□ -2.21
CRC1Q12289 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.23□□□□□ -2.21
CRC1Q12289 CDC39YCR093W 6327 nt1.21□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 SEC3YER008C 4011 nt1.21□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 YLR232WYLR232W 348 nt1.21□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 YMR326CYMR326C 309 nt1.21□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 AZF1YOR113W 2745 nt1.2□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 IRA1YBR140C 9279 nt1.2□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.2□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 MEC1YBR136W 7107 nt1.19□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 NUP145YGL092W 3954 nt1.19□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 SPC110YDR356W 2835 nt1.19□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 EST2YLR318W 2655 nt1.19□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 CCH1YGR217W 6120 nt1.19□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 snR61snR61 90 nt1.18□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 NUP192YJL039C 5052 nt1.17□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 COG6YNL041C 2520 nt1.17□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 RAD9YDR217C 3930 nt1.17□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 SXM1YDR395W 2835 nt1.16□□□□□ -2.22
CRC1Q12289 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 HKR1YDR420W 5409 nt1.15□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 YDR210WYDR210W 228 nt1.14□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 STF2YGR008C 255 nt1.14□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 RCO1YMR075W 2055 nt1.14□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 YHR217CYHR217C 462 nt1.13□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 CHS1YNL192W 3396 nt1.13□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.12□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 SEC8YPR055W 3198 nt1.11□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 KAP120YPL125W 3099 nt1.11□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.11□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 PET127YOR017W 2403 nt1.11□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 FYV8YGR196C 2454 nt1.1□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 SEC1YDR164C 2175 nt1.09□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.09□□□□□ -2.23
CRC1Q12289 PRP16YKR086W 3216 nt1.09□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 CAT8YMR280C 4302 nt1.08□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.08□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 MSN5YDR335W 3675 nt1.08□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 PIK1YNL267W 3201 nt1.07□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.07□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.06□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 CDC25YLR310C 4770 nt1.06□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 ROM2YLR371W 4071 nt1.05□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 BIR1YJR089W 2865 nt1.05□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 SBH1YER087C-B 249 nt1.05□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 YDL073WYDL073W 2955 nt1.05□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 ANS1YHR126C 480 nt1.04□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 BEM3YPL115C 3387 nt1.04□□□□□ -2.24
CRC1Q12289 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.02□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YNL266WYNL266W 420 nt1.02□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YJR029WYJR029W 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.01□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 SAC3YDR159W 3906 nt1.01□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 LAA1YJL207C 6045 nt1.01□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 SPT7YBR081C 3999 nt1□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 MSH3YCR092C 3057 nt1□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 BUD3YCL014W 4911 nt1□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 UBP3YER151C 2739 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YSP1YHR155W 3687 nt0.99□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.98□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 MYO1YHR023W 5787 nt0.98□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 NNF2YGR089W 2811 nt0.97□□□□□ -2.25
CRC1Q12289 RPM2YML091C 3609 nt0.96□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 snR81snR81 201 nt0.95□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 CLU1YMR012W 3834 nt0.95□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 GLG1YKR058W 1851 nt0.94□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 YGR130CYGR130C 2451 nt0.94□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 ULP2YIL031W 3105 nt0.93□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.92□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.92□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.91□□□□□ -2.26
CRC1Q12289 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.9□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.89□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.88□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 SEC10YLR166C 2616 nt0.88□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.87□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 IML1YJR138W 4755 nt0.86□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 VAM6YDL077C 3150 nt0.86□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.85□□□□□ -2.27
CRC1Q12289 SIP4YJL089W 2490 nt0.83□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 EST1YLR233C 2100 nt0.83□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.83□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.83□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 CSE1YGL238W 2883 nt0.82□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 HUG1YML058W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.82□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 BUL2YML111W 2763 nt0.81□□□□□ -2.28
CRC1Q12289 NST1YNL091W 3723 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms