Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP1B1Q10567 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms