Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300CQ08708 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms