Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1Q07954 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms