Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-1Q07627 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms