Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEUP1Q05D60 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms