Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 CHS1YNL192W 3396 nt1.65□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 BST1YFL025C 3090 nt1.65□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 ROM2YLR371W 4071 nt1.65□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 FYV10YIL097W 1551 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 snR190snR190 190 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 NUP145YGL092W 3954 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 PET127YOR017W 2403 nt1.64□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.63□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 YLR232WYLR232W 348 nt1.63□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 CCH1YGR217W 6120 nt1.63□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 YLR041WYLR041W 321 nt1.62□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 snR61snR61 90 nt1.61□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 STF2YGR008C 255 nt1.61□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 GEA2YEL022W 4380 nt1.61□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 AZF1YOR113W 2745 nt1.59□□□□□ -2.15
HRQ1Q05549 MSH3YCR092C 3057 nt1.58□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 SEC3YER008C 4011 nt1.58□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 SSK2YNR031C 4740 nt1.58□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.58□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 FYV8YGR196C 2454 nt1.57□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 SXM1YDR395W 2835 nt1.57□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.57□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 snR39BsnR39B 96 nt1.57□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 CLU1YMR012W 3834 nt1.56□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 YHR217CYHR217C 462 nt1.55□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 EST2YLR318W 2655 nt1.55□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 NUP188YML103C 4968 nt1.54□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 NUP157YER105C 4176 nt1.54□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 ASE1YOR058C 2658 nt1.53□□□□□ -2.16
HRQ1Q05549 SEC8YPR055W 3198 nt1.53□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 RPM2YML091C 3609 nt1.52□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 LAA1YJL207C 6045 nt1.52□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 RAD9YDR217C 3930 nt1.51□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 SPC110YDR356W 2835 nt1.51□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 TRM732YMR259C 4263 nt1.51□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 BEM2YER155C 6504 nt1.51□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.5□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 SBH1YER087C-B 249 nt1.49□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 PRP16YKR086W 3216 nt1.49□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 HUG1YML058W-A 207 nt1.48□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 PIK1YNL267W 3201 nt1.48□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 MSN5YDR335W 3675 nt1.47□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 BEM3YPL115C 3387 nt1.47□□□□□ -2.17
HRQ1Q05549 YDR210WYDR210W 228 nt1.46□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.46□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YGR130CYGR130C 2451 nt1.46□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 KAP120YPL125W 3099 nt1.46□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.45□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.45□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 COG6YNL041C 2520 nt1.45□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.44□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 HKR1YDR420W 5409 nt1.43□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.41□□□□□ -2.18
HRQ1Q05549 YDL073WYDL073W 2955 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.4□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 YSP1YHR155W 3687 nt1.39□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 BIR1YJR089W 2865 nt1.39□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 CDC39YCR093W 6327 nt1.37□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.37□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 SEC1YDR164C 2175 nt1.37□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 IML1YJR138W 4755 nt1.36□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 YNL266WYNL266W 420 nt1.36□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 RCO1YMR075W 2055 nt1.36□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 UBP3YER151C 2739 nt1.34□□□□□ -2.19
HRQ1Q05549 SCC2YDR180W 4482 nt1.33□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 DOP1YDR141C 5097 nt1.32□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 BUD3YCL014W 4911 nt1.32□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.31□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.31□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.3□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 YPR117WYPR117W 7470 nt1.3□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 ULP2YIL031W 3105 nt1.3□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 GLG1YKR058W 1851 nt1.29□□□□□ -2.2
HRQ1Q05549 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.24□□□□□ -2.21
HRQ1Q05549 SIP4YJL089W 2490 nt1.24□□□□□ -2.21
HRQ1Q05549 SPT7YBR081C 3999 nt1.23□□□□□ -2.21
HRQ1Q05549 snR81snR81 201 nt1.22□□□□□ -2.21
HRQ1Q05549 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.22□□□□□ -2.21
HRQ1Q05549 NNF2YGR089W 2811 nt1.21□□□□□ -2.22
HRQ1Q05549 VAM6YDL077C 3150 nt1.18□□□□□ -2.22
HRQ1Q05549 SEC10YLR166C 2616 nt1.18□□□□□ -2.22
HRQ1Q05549 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.17□□□□□ -2.22
HRQ1Q05549 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.17□□□□□ -2.22
HRQ1Q05549 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.14□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.14□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 NST1YNL091W 3723 nt1.13□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 CSE1YGL238W 2883 nt1.12□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 PAU12YGR294W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 PAU24YBR301W 363 nt1.11□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 UTP20YBL004W 7482 nt1.1□□□□□ -2.23
HRQ1Q05549 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.07□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.06□□□□□ -2.24
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