Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EMX2Q04743 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms