Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms