Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms