Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VLDLRP98155 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms