Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP1P78357 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms