Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms