Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTG1P63261 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms