Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LSM3P62310 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSM3P62310 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSM3P62310 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms