Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVPABLB-1P60509 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms