Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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