Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FAM3BP58499 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3BP58499 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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