Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB25P57735 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms