Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIPPLY3P57055 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RIPPLY3P57055 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms