Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRPF1P55201 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRPF1P55201 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms