Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLTPP55058 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLTPP55058 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PLTPP55058 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms