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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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1,224 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
UBP2
YOR124C
3819 nt
2.2
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
NEO1
YIL048W
3456 nt
2.18
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
FKS1
YLR342W
5631 nt
2.17
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
SPP41
YDR464W
4308 nt
2.16
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
snR47
snR47
99 nt
2.16
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
MYO2
YOR326W
4725 nt
2.15
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
HER1
YOR227W
3741 nt
2.15
□□□□□ -2.06
MSN5
P52918
snR190
snR190
190 nt
2.15
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
GLG1
YKR058W
1851 nt
2.15
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
PMD1
YER132C
5262 nt
2.15
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
UBR2
YLR024C
5619 nt
2.15
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
snR14
snR14
160 nt
2.14
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
YMR045C
YMR045C
5268 nt
2.14
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
NOP9
YJL010C
2001 nt
2.13
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
SSK2
YNR031C
4740 nt
2.13
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
RPL26B
YGR034W
384 nt
2.13
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
EMC5
YIL027C
426 nt
2.13
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
ORC3
YLL004W
1851 nt
2.12
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
YHR214C-B
YHR214C-B
5382 nt
2.11
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
snR64
snR64
101 nt
2.1
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
2.1
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
USO1
YDL058W
5373 nt
2.1
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
SEC10
YLR166C
2616 nt
2.09
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
SMC4
YLR086W
4257 nt
2.09
□□□□□ -2.07
MSN5
P52918
ASE1
YOR058C
2658 nt
2.07
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
WAR1
YML076C
2835 nt
2.07
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
DNF3
YMR162C
4971 nt
2.07
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
YLR422W
YLR422W
5799 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
AZF1
YOR113W
2745 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
CHS1
YNL192W
3396 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
ATG9
YDL149W
2994 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
RAD9
YDR217C
3930 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
PIK1
YNL267W
3201 nt
2.06
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
GEA2
YEL022W
4380 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
CFT1
YDR301W
4074 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
TDA9
YML081W
3756 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
PAU12
YGR294W
363 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
YBR200W-A
YBR200W-A
165 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
PAU24
YBR301W
363 nt
2.05
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
STO1
YMR125W
2586 nt
2.04
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
RPM2
YML091C
3609 nt
2.04
□□□□□ -2.08
MSN5
P52918
YDL073W
YDL073W
2955 nt
2.02
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
MGA2
YIR033W
3342 nt
2.02
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
KAP122
YGL016W
3246 nt
2.01
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
snR50
snR50
90 nt
2.01
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
YGR130C
YGR130C
2451 nt
2.01
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
TMA7
YLR262C-A
195 nt
2
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
NNF2
YGR089W
2811 nt
2
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
UBP3
YER151C
2739 nt
1.99
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
CCH1
YGR217W
6120 nt
1.99
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
BEM3
YPL115C
3387 nt
1.98
□□□□□ -2.09
MSN5
P52918
CAT8
YMR280C
4302 nt
1.96
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
YMR247W-A
YMR247W-A
144 nt
1.96
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
tT(UGU)H
tT(UGU)H
72 nt
1.95
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
MSH3
YCR092C
3057 nt
1.94
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
FIG2
YCR089W
4830 nt
1.94
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
SKI3
YPR189W
4299 nt
1.94
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
PRP16
YKR086W
3216 nt
1.93
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
MON2
YNL297C
4911 nt
1.93
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
1.92
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
YBR109W-A
YBR109W-A
225 nt
1.92
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
1.91
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
ROM2
YLR371W
4071 nt
1.91
□□□□□ -2.1
MSN5
P52918
YKL225W
YKL225W
348 nt
1.9
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
APL3
YBL037W
3078 nt
1.89
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
BRR2
YER172C
6492 nt
1.89
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
KCS1
YDR017C
3153 nt
1.89
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
YLR299C-A
YLR299C-A
93 nt
1.88
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
1.88
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
SEC8
YPR055W
3198 nt
1.87
□□□□□ -2.11
MSN5
P52918
PKH3
YDR466W
2697 nt
1.84
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
SEC3
YER008C
4011 nt
1.83
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
EST1
YLR233C
2100 nt
1.83
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
YCS4
YLR272C
3531 nt
1.83
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
SWI4
YER111C
3282 nt
1.81
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
1.8
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
1.8
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
LAA1
YJL207C
6045 nt
1.8
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
YSP1
YHR155W
3687 nt
1.79
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
TRM732
YMR259C
4263 nt
1.78
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
snR69
snR69
101 nt
1.78
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
PET127
YOR017W
2403 nt
1.78
□□□□□ -2.12
MSN5
P52918
ULP2
YIL031W
3105 nt
1.77
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
MEC1
YBR136W
7107 nt
1.76
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
IML1
YJR138W
4755 nt
1.76
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
CLU1
YMR012W
3834 nt
1.76
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
NUP188
YML103C
4968 nt
1.75
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
YLR149C-A
YLR149C-A
87 nt
1.75
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
CSE1
YGL238W
2883 nt
1.75
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
NUP145
YGL092W
3954 nt
1.74
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
VPS15
YBR097W
4365 nt
1.73
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
YML054C-A
YML054C-A
159 nt
1.73
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
CDC25
YLR310C
4770 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
RPL41A
YDL184C
78 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)E1
tH(GUG)E1
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)E2
tH(GUG)E2
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)G1
tH(GUG)G1
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)G2
tH(GUG)G2
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)H
tH(GUG)H
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
MSN5
P52918
tH(GUG)K
tH(GUG)K
72 nt
1.72
□□□□□ -2.13
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