Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 UBP2YOR124C 3819 nt2.2□□□□□ -2.06
MSN5P52918 NEO1YIL048W 3456 nt2.18□□□□□ -2.06
MSN5P52918 FKS1YLR342W 5631 nt2.17□□□□□ -2.06
MSN5P52918 SPP41YDR464W 4308 nt2.16□□□□□ -2.06
MSN5P52918 snR47snR47 99 nt2.16□□□□□ -2.06
MSN5P52918 MYO2YOR326W 4725 nt2.15□□□□□ -2.06
MSN5P52918 HER1YOR227W 3741 nt2.15□□□□□ -2.06
MSN5P52918 snR190snR190 190 nt2.15□□□□□ -2.07
MSN5P52918 GLG1YKR058W 1851 nt2.15□□□□□ -2.07
MSN5P52918 PMD1YER132C 5262 nt2.15□□□□□ -2.07
MSN5P52918 UBR2YLR024C 5619 nt2.15□□□□□ -2.07
MSN5P52918 snR14snR14 160 nt2.14□□□□□ -2.07
MSN5P52918 YMR045CYMR045C 5268 nt2.14□□□□□ -2.07
MSN5P52918 NOP9YJL010C 2001 nt2.13□□□□□ -2.07
MSN5P52918 SSK2YNR031C 4740 nt2.13□□□□□ -2.07
MSN5P52918 RPL26BYGR034W 384 nt2.13□□□□□ -2.07
MSN5P52918 EMC5YIL027C 426 nt2.13□□□□□ -2.07
MSN5P52918 ORC3YLL004W 1851 nt2.12□□□□□ -2.07
MSN5P52918 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.11□□□□□ -2.07
MSN5P52918 snR64snR64 101 nt2.1□□□□□ -2.07
MSN5P52918 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.1□□□□□ -2.07
MSN5P52918 USO1YDL058W 5373 nt2.1□□□□□ -2.07
MSN5P52918 SEC10YLR166C 2616 nt2.09□□□□□ -2.07
MSN5P52918 SMC4YLR086W 4257 nt2.09□□□□□ -2.07
MSN5P52918 ASE1YOR058C 2658 nt2.07□□□□□ -2.08
MSN5P52918 WAR1YML076C 2835 nt2.07□□□□□ -2.08
MSN5P52918 DNF3YMR162C 4971 nt2.07□□□□□ -2.08
MSN5P52918 YLR422WYLR422W 5799 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 AZF1YOR113W 2745 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 CHS1YNL192W 3396 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 ATG9YDL149W 2994 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 RAD9YDR217C 3930 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 PIK1YNL267W 3201 nt2.06□□□□□ -2.08
MSN5P52918 GEA2YEL022W 4380 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 CFT1YDR301W 4074 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 TDA9YML081W 3756 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 PAU12YGR294W 363 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 PAU24YBR301W 363 nt2.05□□□□□ -2.08
MSN5P52918 STO1YMR125W 2586 nt2.04□□□□□ -2.08
MSN5P52918 RPM2YML091C 3609 nt2.04□□□□□ -2.08
MSN5P52918 YDL073WYDL073W 2955 nt2.02□□□□□ -2.09
MSN5P52918 MGA2YIR033W 3342 nt2.02□□□□□ -2.09
MSN5P52918 KAP122YGL016W 3246 nt2.01□□□□□ -2.09
MSN5P52918 snR50snR50 90 nt2.01□□□□□ -2.09
MSN5P52918 YGR130CYGR130C 2451 nt2.01□□□□□ -2.09
MSN5P52918 TMA7YLR262C-A 195 nt2□□□□□ -2.09
MSN5P52918 NNF2YGR089W 2811 nt2□□□□□ -2.09
MSN5P52918 UBP3YER151C 2739 nt1.99□□□□□ -2.09
MSN5P52918 CCH1YGR217W 6120 nt1.99□□□□□ -2.09
MSN5P52918 BEM3YPL115C 3387 nt1.98□□□□□ -2.09
MSN5P52918 CAT8YMR280C 4302 nt1.96□□□□□ -2.1
MSN5P52918 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.96□□□□□ -2.1
MSN5P52918 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.95□□□□□ -2.1
MSN5P52918 MSH3YCR092C 3057 nt1.94□□□□□ -2.1
MSN5P52918 FIG2YCR089W 4830 nt1.94□□□□□ -2.1
MSN5P52918 SKI3YPR189W 4299 nt1.94□□□□□ -2.1
MSN5P52918 PRP16YKR086W 3216 nt1.93□□□□□ -2.1
MSN5P52918 MON2YNL297C 4911 nt1.93□□□□□ -2.1
MSN5P52918 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.92□□□□□ -2.1
MSN5P52918 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.92□□□□□ -2.1
MSN5P52918 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.91□□□□□ -2.1
MSN5P52918 ROM2YLR371W 4071 nt1.91□□□□□ -2.1
MSN5P52918 YKL225WYKL225W 348 nt1.9□□□□□ -2.11
MSN5P52918 APL3YBL037W 3078 nt1.89□□□□□ -2.11
MSN5P52918 BRR2YER172C 6492 nt1.89□□□□□ -2.11
MSN5P52918 KCS1YDR017C 3153 nt1.89□□□□□ -2.11
MSN5P52918 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.88□□□□□ -2.11
MSN5P52918 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.88□□□□□ -2.11
MSN5P52918 SEC8YPR055W 3198 nt1.87□□□□□ -2.11
MSN5P52918 PKH3YDR466W 2697 nt1.84□□□□□ -2.12
MSN5P52918 SEC3YER008C 4011 nt1.83□□□□□ -2.12
MSN5P52918 EST1YLR233C 2100 nt1.83□□□□□ -2.12
MSN5P52918 YCS4YLR272C 3531 nt1.83□□□□□ -2.12
MSN5P52918 SWI4YER111C 3282 nt1.81□□□□□ -2.12
MSN5P52918 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.8□□□□□ -2.12
MSN5P52918 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.8□□□□□ -2.12
MSN5P52918 LAA1YJL207C 6045 nt1.8□□□□□ -2.12
MSN5P52918 YSP1YHR155W 3687 nt1.79□□□□□ -2.12
MSN5P52918 TRM732YMR259C 4263 nt1.78□□□□□ -2.12
MSN5P52918 snR69snR69 101 nt1.78□□□□□ -2.12
MSN5P52918 PET127YOR017W 2403 nt1.78□□□□□ -2.12
MSN5P52918 ULP2YIL031W 3105 nt1.77□□□□□ -2.13
MSN5P52918 MEC1YBR136W 7107 nt1.76□□□□□ -2.13
MSN5P52918 IML1YJR138W 4755 nt1.76□□□□□ -2.13
MSN5P52918 CLU1YMR012W 3834 nt1.76□□□□□ -2.13
MSN5P52918 NUP188YML103C 4968 nt1.75□□□□□ -2.13
MSN5P52918 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.75□□□□□ -2.13
MSN5P52918 CSE1YGL238W 2883 nt1.75□□□□□ -2.13
MSN5P52918 NUP145YGL092W 3954 nt1.74□□□□□ -2.13
MSN5P52918 VPS15YBR097W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
MSN5P52918 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.73□□□□□ -2.13
MSN5P52918 CDC25YLR310C 4770 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 RPL41AYDL184C 78 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.72□□□□□ -2.13
MSN5P52918 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.72□□□□□ -2.13
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