Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNA2P51530 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNA2P51530 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNA2P51530 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNA2P51530 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNA2P51530 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNA2P51530 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms