Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCAMP50895 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCAMP50895 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCAMP50895 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCAMP50895 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCAMP50895 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms