Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ME1P48163 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ME1P48163 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ME1P48163 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ME1P48163 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ME1P48163 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ME1P48163 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms